Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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