Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms