Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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