Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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