Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RAB35Q15286 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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