Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA5AQ13591 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA5AQ13591 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms