Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C1orf61Q13536 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C1orf61Q13536 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C1orf61Q13536 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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