Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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