Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMARCB1Q12824 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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