Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP3CAQ08209 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms