Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABPAQ06546 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms