Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6Q03468 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms