Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms