Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RPS29P62273 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms