Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HADHBP55084 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms