Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLMP48507 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLMP48507 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms