Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTR1BP42025 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTR1BP42025 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms