Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms