Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms