Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTSSP25774 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CTSSP25774 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTSSP25774 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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CTSSP25774 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTSSP25774 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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