Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APODP05090 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APODP05090 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APODP05090 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms