Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms