Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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ZNF879B4DU55 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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