Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms