Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIT1Q9Y2X7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIT1Q9Y2X7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms