Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERINC1Q9NRX5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms