Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
UBQLN4Q9NRR5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms