Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SSBP4Q9BWG4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms