Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms