Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms