Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP13Q92995 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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