Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms