Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms