Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HADHQ16836 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HADHQ16836 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HADHQ16836 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HADHQ16836 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HADHQ16836 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HADHQ16836 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HADHQ16836 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HADHQ16836 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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