Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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