Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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