Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PMCHL1Q16048 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PMCHL1Q16048 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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PMCHL1Q16048 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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