Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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