Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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