Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TUBA3CQ13748 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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