Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALCAMQ13740 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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