Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX6Q13608 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms