Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR5A1Q13285 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms