Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTP4A2Q12974 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTP4A2Q12974 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTP4A2Q12974 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTP4A2Q12974 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTP4A2Q12974 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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