Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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STX4Q12846 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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