Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSME1Q06323 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms