Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms