Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF85Q03923 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms