Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms