Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms